V súčasnom období Spoločný technický sekretariát finalizuje formálnu kontrolu a kontrolu oprávnenosti projektov prijatých v rámci prvej výzvy na predkladanie žiadostí o finančný príspevok. V prípade nepresností resp. nejasných informácii uvedených vo formulári žiadostí o poskytnutie finančného príspevku a jeho príloh alebo v prípade chýbajúcich dokumentov vyzve Spoločný technický sekretariát žiadateľov aby poskytli vysvetlenie alebo zaslali chýbajúce dokumenty v stanovenom termíne. Uvedené oznámenie bude žiadateľom zaslané počas prvého decembrového týždňa roku 2010.
Po predložení záverov formálnej kontroly a kontroly oprávnenosti projektov bude zvolaná Výberová komisia (jedna výberová komisia na každú priority), ktorá odporučí projekty na ďalšie hodnotenie alebo projekty zamietne. Spoločný riadiaci organ následne zostaví zoznam projektov odporučených na ďalšie hodnotenie resp. zamietnutie a uvedený zoznam schváli Spoločný monitorovací výbor.
Na záver formálnej kontroly a kontroly oprávnenosti, ktorá by mala byť uzavretá v polovici januára 2010, Spoločný technický sekretariát zašle žiadateľom list, obsahujúci nasledovné informácie:
- či bola projektová žiadosť zaslaná pred uzávierkou prijímania projektových žiadostí;
- pridelené registračné číslo projektovej žiadosti;
- či projektová žiadosť vyhovela podmienkam formálnej kontroly a kontroly oprávnenosti;
- či bola projektová žiadosť odporučená na kvalitatívne hodnotenie;
- v prípade vylúčenia z kvalitatívneho hodnotenia bude poskytnutý zoznam dôvodov vylúčenia.
Vybraní externí hodnotitelia podrobia projektové žiadosti kvalitatívnemu hodnoteniu. Podľa záverov nimi vykonaného externého hodnotenia bude Výberová komisia posudzovať hodnotené projekty a konečné rozhodnutie ohľadom schválenia projektov a ich rozpočtov vykoná Spoločný monitorovací výbor v prvom štvrťroku 2010.
Po podpise zmlúv so žiadateľmi sa začne fáza samotnej implementácie schválených projektov, plánovaná v mesiaci marec 2010.